Wyrok WSA w Olsztynie z dnia 15 stycznia 2025 r., sygn. I SA/Ol 451/24

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Olsztynie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Przemysław Krzykowski (sprawozdawca) Sędziowie sędzia WSA Andrzej Brzuzy sędzia WSA Anna Janowska Protokolant sekretarz sądowy Elżbieta Parda po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 15 stycznia 2025r. sprawy ze skargi L. Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w E. na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Olsztynie z dnia 4 października 2024r., nr 2801-IOD.4100.4.2024 w przedmiocie podatku dochodowego od osób prawnych za 2019 r. oddala skargę.

Uzasadnienie

Zaskarżoną decyzją z 4 października 2024 r. Dyrektor Izby Administracji Skarbowej w Olsztynie (dalej: Dyrektor, organ odwoławczy) po rozpatrzeniu odwołania L. Spółki z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w E. (dalej: Spółka, strona, skarżąca) uchylił decyzję Naczelnika Warmińsko-Mazurskiego Urzędu Celno-Skarbowego w O. (dalej: Naczelnik, organ I instancji) z 7 marca 2024 r. w całości i określił zobowiązanie w podatku dochodowym od osób prawnych za 2019 r. w wysokości 103.591,00 zł.

Z akt sprawy oraz uzasadnienia zaskarżonej decyzji wynika, że Naczelnik decyzją z 7 marca 2024 r., określił Spółce kwotę zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób prawnych za 2019 r. w wysokości 123.630,00 zł. Organ I instancji wskazał, że wraz z zeznaniem CIT-8 za 2019 r. Spółka złożyła: informację CIT-8/O o odliczeniach od dochodu i od podatku oraz o dochodach wolnych i zwolnionych od podatku, informację CIT/8S o wysokości dochodu osiągniętego z działalności gospodarczej prowadzonej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej na podstawie zezwolenia lub na terenie określonym w decyzji o wsparciu oraz informację CIT/BR o odliczeniach od podstawy opodatkowania kosztów uzyskania przychodów poniesionych na działalność badawczo-rozwojową. Wykazała w nich dochody wolne i odliczenia zmniejszające podstawę opodatkowania związane głównie z działalnością prowadzoną w specjalnej strefie ekonomicznej oraz działalnością badawczo-rozwojową. Organ kontroli celno-skarbowej działając na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (tj. Dz.U. z 2019 r. poz. 865 ze zm.) stwierdził, że Spółka rozpoczęła działalność w specjalnej strefie ekonomicznej od 1.04.2019 r. i zakwestionował jej odliczenie dochodów wolnych za okres od stycznia do marca 2019 r. Określił dochody wolne z ww. tytułu w wysokości 1.426.888,26 zł, zamiast kwoty 1.929.130.64 zł wykazanej przez Spółkę. Ponadto, działając na podstawie art. 9 ust. 1b ww. ustawy stwierdził, że Spółka zawyżyła koszty działalności badawczo-rozwojowej dotyczące wynagrodzeń pracowników i określił je w wysokości 39.912.47 zł, zamiast kwoty 192.898,07 zł wykazanej przez Spółkę. Uwzględniając powyższe ustalenia organ określił Spółce zobowiązanie w podatku dochodowym od osób prawnych za 2019 r. w wysokości 123.630,00 zł. Po rozpatrzeniu odwołania, decyzją z 4 października 2024 r., Dyrektor uchylił decyzję organu I instancji w całości i określił zobowiązanie w podatku dochodowym od osób prawnych za 2019 r. w wysokości 103.591,00 zł. Wskazał, że kwestią sporną w sprawie jest prawidłowość ustaleń organu kontroli celno-skarbowej w zakresie działalności strony w specjalnej strefie ekonomicznej, w wyniku których organ przyjął, że Spółka rozpoczęła produkcję w strefie (w położonym w niej zakładzie przy ul. [...] w E.) dopiero od 1.04.2019 r. oraz zakwestionowanie wynagrodzeń części pracowników, jako kosztów kwalifikowanych, dotyczących działalności badawczo-rozwojowej ww. Spółki.