Wyrok WSA w Warszawie z dnia 12 marca 2013 r., sygn. III SA/Wa 2914/12

Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodnicząca Sędzia WSA Krystyna Kleiber, Sędziowie Sędzia WSA Barbara Kołodziejczak-Osetek (sprawozdawca), Sędzia WSA Grzegorz Nowecki, Protokolant starszy referent Iwona Choińska, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 12 marca 2013 r. sprawy ze skargi J. S.A. z siedzibą w Z. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia [...] lipca 2012 r. nr [...] w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych za 2003 r. 1) uchyla zaskarżoną decyzję, 2) stwierdza, że uchylona decyzja nie może być wykonana w całości, 3) zasądza od Dyrektora Izby Skarbowej w W. na rzecz J. S.A. z siedzibą w Z. kwotę 17.419 zł (słownie: siedemnaście tysięcy czterysta dziewiętnaście złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.

Uzasadnienie

Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w R. decyzją z [...] grudnia 2011 r. odmówił Skarżącej - J. SA w Z. stwierdzenia nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych za rok 2003 r.

W uzasadnieniu wskazał, że 30 grudnia 2009 r. Skarżąca nadał w urzędzie pocztowym W. [...] przesyłkę zawierającą wniosek o stwierdzenie nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych za 2003 r. w kwocie 766.007 zł wraz z korektą zeznania o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) przez podatnika podatku dochodowego od osób prawnych za rok podatkowy 2003. W dniu 4 stycznia 2010 r. powyższe dokumenty wpłynęły do właściwego miejscowo [...] Urzędu Skarbowego w R.. Skarżąca, uzasadniając złożenie korekty zeznania wskazała na rozstrzygnięcie zawarte w decyzji Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w L. z [...] grudnia 2005 r., zgodnie z którym koszty uzyskania przychodów w wysokości 2.837.003,65 zł zaliczone do kosztów w 2004 r. powinny zostać rozliczone w podatku dochodowym za rok 2003.

Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w R. wyjasnił, że postanowieniem z [...] stycznia 2010 r., odmówił wszczęcia postępowania w sprawie wniosku o stwierdzenie nadpłaty. W przyjętym rozstrzygnięciu organ pierwszej instancji stwierdził, iż w przedmiotowej sprawie nie ma zastosowania zapis art. 12 § 6 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2005 r. Nr 8, poz. 60 ze zm.) - dalej "O.p.". Wskazał, że w świetle art. 79 § 2 w/w ustawy wniosek o stwierdzenie nadpłaty złożony został przed upływem terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego, ale biorąc pod uwagę brzmienie art. 165 § 3 O.p. postępowanie w sprawie stwierdzenia nadpłaty nie może być wszczęte, gdyż doręczenie żądania organowi podatkowemu nastąpiło 4 stycznia 2010 r., tj. po upływie terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego. Skarżąca 1 lutego 2010 r. złożył zażalenie na powyższe rozstrzygnięcie. Dyrektor Izy Skarbowej w W., postanowieniem [...] kwietnia 2010 r., utrzymał w mocy w/w postanowienie Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w R.. Skarżąca złożyła skargę na w/w postanowienie do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie, który wyrokiem z 1 lutego 2011 r. sygn. akt III SA/Wa 1419/10 uchylił zaskarżone postanowienie Dyrektora Izby Skarbowej w W. z [...] kwietnia 2010 r., oraz poprzedzające je postanowienie Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w R. z [...] stycznia 2010 r.