3. Skutkiem wniesienia aportu jest korekta podatku naliczonego
Wniesienie aportem towarów handlowych zawsze powoduje obowiązek korekty podatku naliczonego, bez względu na okres, w którym nastąpi aport. Korekty podatku naliczonego wymaga również wniesienie aportem środków trwałych. Skutki te powoduje zarówno aport do spółki prawa cywilnego, jak i handlowego. Takie stanowisko zajęło Ministerstwo Finansów w piśmie wydanym w celu ujednolicenia stosowania przepisów prawa podatkowego (pismo z 27 marca 2007 r., nr PT5-033-13/EK/2006/AP-7828/7789). Treść pisma jest dostępna na stronie internetowej „MONITORA księgowego” www.mk.infor.pl.
W orzecznictwie i praktyce organów podatkowych panowały rozbieżne poglądy w sprawie skutków podatkowych, jakie niesie ze sobą wniesienie aportem towarów handlowych i środków trwałych do spółki. Zdaniem części specjalistów aport nie powinien powodować obowiązku korekty podatku naliczonego, gdy będą one nadal wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych. Pozostali twierdzili, że aport jako czynność zwolniona z VAT powoduje obowiązek korekty podatku naliczonego.