Fundusze europejskie - zagadnienia podatkowe a dotacje
W przypadku korzystania z funduszy europejskich istotne znaczenie mają też kwestie podatkowe. Często podatnicy mają wątpliwości, czy VAT można zaliczyć do kosztów kwalifikowanych. Ponadto jakie są skutki w podatku dochodowym otrzymania dotacji?
Określenie "VAT jako koszt kwalifikowany" wynika z rozporządzenia Unii Europejskiej, którego przepisy państwa członkowskie Wspólnoty Europejskiej powinny bezpośrednio stosować.
W załączniku do rozporządzenia Komisji (WE) nr 448/2004 określającego zasady kwalifikowania wydatków wprowadzono m.in. zasadę nr 7 dotyczącą VAT i innych podatków oraz opłat:
1. VAT nie jest wydatkiem kwalifikowanym, z wyjątkiem przypadków, gdy jest on faktycznie i ostatecznie wytworzony przez końcowego beneficjenta lub indywidualnego odbiorcę w ramach programu pomocy zgodnie z art. 87 Traktatu oraz w przypadku pomocy finansowanej przez instytucję wyznaczoną przez państwo członkowskie. VAT, który podlega zwrotowi przy zastosowaniu jakichkolwiek środków, nie może być uznany za wydatek kwalifikowany, nawet jeżeli końcowy beneficjent lub indywidualny odbiorca nie odzyska go w danym momencie. Przy ustalaniu, czy VAT stanowi wydatek kwalifikowany zgodnie z zapisami niniejszych zasad, nie jest brany pod uwagę publiczny lub prywatny status beneficjenta końcowego lub odbiorcy.
2. VAT, którego zwrotu beneficjent końcowy lub odbiorca końcowy nie może uzyskać na mocy określonych przepisów krajowych, stanowi wydatek kwalifikowany tylko wtedy, gdy takie przepisy są pod każdym względem zgodne z szóstą dyrektywą Rady nr 77/388/EWG w sprawie VAT.
3. W przypadku gdy końcowy beneficjent lub indywidualny odbiorca podlega programowi pomocy zryczałtowanej, zgodnie z tytułem XIV szóstej dyrektywy Rady 77/388/EWG w sprawie VAT, dla potrzeb pkt 1 zapłacony VAT jest uznawany za podlegający zwrotowi.
4. Bez naruszania przepisów art. 29 ust. 6 rozporządzenia ogólnego współfinansowanie ze strony Wspólnoty nie może przekroczyć całkowitych kosztów kwalifikowanych, z wyłączeniem VAT.