Czy sprzedaż ulepszonego środka trwałego jest opodatkowana VAT

Jestem osobą fizyczną prowadzącą działalność gospodarczą, czynnym podatnikiem VAT. W 2011 r. nabyłam na podstawie umowy kupna-sprzedaży specjalistyczny przyrząd za 25 000 zł, który wprowadziłam do ewidencji środków trwałych z wartością początkową 30 500 zł: przyrząd 25 000 zł + PCC 500 zł + dodatkowa część 5000 zł netto. Od dodatkowej części odliczono VAT 1150 zł. Czy po sprzedaży przyrządu w 2014 r. powinnam wystawić fakturę ze zwolnioną stawką VAT oraz czy mam obowiązek 5-letniej korekty VAT? Czy zakupiona na fakturę VAT dodatkowa część traktowana jest jak modernizacja ŚT i traktuje się ją jak osobny składnik, który ze względu na wartość poniżej 15 000 zł nie powoduje konieczności korekty VAT po 12 miesiącach od zakupu?