Kiedy wyodrębniać podatek podlegający proporcjonalnemu odliczeniu

W związku z nowelizacją ustawy o VAT będziemy pozbawieni odliczenia VAT w 100% od zakupów związanych ze sprzedażą mieszaną. Dotychczas proporcja w naszej spółce wynosiła 99%. Nie mamy doświadczenia w proporcjonalnym rozliczaniu VAT. W którym momencie powinniśmy zastosować proporcję? Czy w momencie księgowania każdej faktury zakupu dokonywać podziału podatku na część podlegającą odliczeniu i niepodlegającą, czy może dokonywać podziału podatku łącznie na koniec miesiąca?