Czy faktycznie poniesione koszty dojazdu do pracy można udokumentować fakturą VAT

Jeden z naszych pracowników dojeżdża do pracy prywatną linią komunikacyjną. Wydatki na ten cel są udokumentowane fakturą VAT wystawioną przez firmę przewozową. W ciągu roku stosujemy do wynagrodzenia tego pracownika zryczałtowane koszty uzyskania przychodów. Czy w zeznaniu rocznym pracownik może zastosować koszty uzyskania przychodów w wysokości faktycznie poniesionej udokumentowanej fakturą VAT?