Skutki nadania numeru NIP na podstawie zgłoszenia aktualizacyjnego

Prowadzę z mężem działalność gospodarczą w formie spółki cywilnej. Kilka lat temu dowiedzieliśmy się, że prowadzimy działalność w ramach tzw. nieformalnej spółki małżeńskiej, a nie spółki cywilnej. W związku z tym postanowiliśmy uregulować administracyjnie sytuację prawną przedsiębiorstwa, które zarejestrowaliśmy pod nowym numerem wpisu do ewidencji działalności gospodarczej, z dokładnym oznaczeniem, że jesteśmy wspólnikami spółki cywilnej, przy czym rodzaj prowadzonej przez nas działalności nie uległ zmianie. Samą umowę spółki cywilnej sporządziliśmy na piśmie 5 czerwca 1999 r. W czerwcu 1999 r. złożyliśmy również zgłoszenie aktualizacyjne na formularzu NIP, zgodnie z pouczeniem pracownika urzędu skarbowego. Urząd skarbowy uznał jednak, że powinniśmy jako spółka otrzymać nowy NIP, gdyż dalsze posługiwanie się NIP mojego męża do identyfikacji podatkowej i rozliczeń z VAT jest wadliwe. Na podstawie zgłoszenia aktualizacyjnego przyznano nam w 2001 r. nowy numer NIP (a więc po upływie dwóch lat od złożenia aktualizacji). Następnie w 2003 r. izba skarbowa uznała, że przyznanie NIP na podstawie zgłoszenia aktualizacyjnego jest niedopuszczalne, i wszczęła postępowanie w sprawie stwierdzenia jego nieważności. Czujemy się pokrzywdzeni, gdyż naszą intencją było uregulowanie sytuacji podatkowoprawnej i, składając zgłoszenie na formularzu NIP-2 w czerwcu 1999 r., nie wykluczaliśmy możliwości przyznania nam nowego numeru identyfikacyjnego. Decyzję w tej sprawie pozostawiliśmy urzędowi skarbowemu, dlatego też w formularzu nie zostało wypełnione miejsce przeznaczone na wpisanie NIP. Czy fakt, że numer identyfikacji podatkowej został przyznany na podstawie zgłoszenia aktualizacyjnego, stanowi podstawę do stwierdzenia nieważności decyzji o jego przyznaniu? Tego typu formalizm urzędniczy podważa wiarygodność naszej firmy w oczach kontrahentów.