Jak ująć w księgach rachunkowych fakturę z kwotą inną niż wcześniej uzgodniona

Spółka otrzymała od kontrahenta fakturę za wykonaną usługę. Widnieją na niej jednak niewłaściwe kwoty tej usługi (inne niż uzgodnione wcześniej). Jak rozliczyć w księgach rachunkowych „zakwestionowanie” części kwoty z otrzymanej faktury?