Rozliczenie transakcji sprzedaży złomu

Pracownik Sp. zo.o. sprzedał dwukrotnie złom, jaki powstał przy realizacji zleceń budowlanych, na własne imię i nazwisko (jako osoba fizyczna). Uzyskane kwoty w wysokości 176 zł i 1982 zł wpłacił do kasy spółki doręczając również rachunek (bez VAT) wystawiony przez skup złomu. Sprzedaż złomu związana z działalnością spółki powinna być udokumentowana FV bez VAT z adnotacją „podatek płaci nabywca”. Nabywca złomu nie wyraził zgody na przyjęcie jakichkolwiek dokumentów od spółki po dniu zaewidencjonowania transakcji. Co w takiej sytuacji powinna zrobić spółka - naliczyć VAT należny wystawiając fakturę wewnętrzną i odprowadzić od US, czy zaewidencjonować jako przychód, pomijając ewidencje VAT?