Wyrok WSA w Warszawie z dnia 10 czerwca 2014 r., sygn. III SA/Wa 3193/13
Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodnicząca sędzia WSA Jolanta Sokołowska, Sędziowie sędzia WSA Waldemar Śledzik, sędzia WSA Marta Waksmundzka-Karasińska (sprawozdawca), Protokolant starszy referent Monika Olszewska, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 10 czerwca 2014 r. sprawy ze skargi D.sp. z o.o. z siedzibą w W. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia [...] października 2013 r. nr [...] w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku od towarów i usług za październik 2004 r. oddala skargę
Uzasadnienie
Z akt administracyjnych wynika, iż Skarżąca - D. Sp. z o.o. złożyła do [...] Urzędu Skarbowego wniosek o stwierdzenie na podstawie art. 72 § 1 pkt 1 w zw. z art. 73 § 1 w zw. z art. 74 pkt 4 w zw. z art. 75 § 2 pkt 5 oraz art. 80 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2012r. poz. 749, ze zm.), dalej: O.p. nadpłaty w podatku od towarów i usług w kwocie 744.180 zł z tytułu zapłaconego dodatkowego zobowiązania podatkowego, ustalonego ostateczną decyzją Dyrektora Izby Skarbowej w W. z [...] lutego 2006r.
W uzasadnieniu wniosku Skarżąca stwierdziła, iż dodatkowe zobowiązanie w wysokości 774.180 zł zostało ustalone na mocy art. 109 ust. 5 i 6 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. Nr 54, poz. 535, ze zm.), dalej: u.p.t.u. (w brzmieniu obowiązującym do 1 grudnia 2008r.), który to przepis zgodnie z orzeczeniem Trybunału Konstytucyjnego z dnia 4 września 2007r., sygn. akt P 43/06 został uznany za niekonstytucyjny. Zdaniem Spółki powyższy wyrok dał podstawę do złożenia przedmiotowego wniosku o stwierdzenie nadpłaty w podatku od towarów i usług z tytułu zapłaty dodatkowego zobowiązania podatkowego. Strona wskazywała także na uchylenie § 14 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004r, w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 97 poz. 970, ze zm.), dalej: rozporządzenia Ministra Finansów; nieuwzględnienie treści art. 88 ust. 3a u.p.t.u., zastosowanie przy orzekaniu art. 109 ust. 5 i 6 u.p.t.u. uchylonego przez ustawodawcę oraz wydanie decyzji przez organ niewłaściwy w sprawie.