Czy można opodatkować ryczałtem umowy zlecenia bądź o dzieło zawarte z pracownikiem

Jestem księgową w spółce z o.o. Spółka zawiera ze swoimi pracownikami drobne umowy zlecenie bądź umowy o dzieło, przy czym umowy o dzieło nie są zawierane z przeniesieniem autorskich praw majątkowych. Wynagrodzenie każdorazowo jest ustalane z zastosowaniem stawki godzinowej, a ilość przepracowanych godzin jest ustalana na podstawie raportu godzinowego. Podatek od wynagrodzeń z tych umów jest rozliczany dwojako: ryczałtem 18% - jeśli suma wszystkich wypłaconych rachunków w danym miesiącu nie przekracza 200 zł, bądź na zasadach ogólnych - w pozostałych przypadkach. Ostatnio jeden z pracowników zakwestionował ryczałtowy sposób opodatkowania, twierdząc że nie ma on zastosowania do tak zawieranych i rozliczanych umów cywilnoprawnych. Czy ten pracownik ma rację?