Czy proporcję można stosować do całego VAT, gdy wykonujemy również czynności niepodlegające opodatkowaniu

Jeżeli zakupy dotyczą trzech rodzajów czynności: opodatkowanych, zwolnionych i niepodlegających VAT, a podatnik nie jest w stanie określić, jaką część zakupów wykorzysta do działalności nieopodatkowanej, to tę część należy rozliczać zgodnie z proporcją ustaloną dla czynności opodatkowanych i zwolnionych. A zatem proporcję ustaloną na podstawie art. 90 ust. 2 i 3 ustawy o VAT należy odnieść do całości podatku naliczonego wynikającego z zakupów. Takie stanowisko zajął Wojewódzki Sąd Administracyjny w Białymstoku w wyroku z 26 września 2012 r., sygn. akt I SA/Bk 245/12 (wyrok prawomocny), którego fragment prezentujemy poniżej.