Stosowanie procedury uproszczonej w imporcie a odliczenie VAT

Znowelizowana ustawa o VAT z 15 lutego 2002 r. o zmianie ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym, o zmianie ustawy o Policji oraz o zmianie ustawy - Kodeks wykroczeń, która weszła w życie 26 marca 2002 r., wprowadziła zmiany w zasadach rozliczania tego podatku przy procedurze uproszczonej. Zmiany dotyczą szczególnego terminu odliczania podatku naliczonego w przypadku stosowania przy imporcie towarów procedury uproszczonej, o której mowa w art. 80 § 1 pkt 3 Kodeksu celnego. Zgodnie z tą regulacją uproszczona procedura celna następuje poprzez wpisanie towarów do rejestrów, które są prowadzone przez osobę mającą pozwolenie na stosowanie takiej procedury. Do czasu wejścia w życie noweli do ustawy powstawały często spory o termin odliczenia VAT. Większość podatników przyjmowała, że rejestr towarów objętych procedurą dopuszczenia do obrotu, w której stosuje się procedurę uproszczoną, nie stanowi dokumentu celnego, będącego podstawą odliczenia VAT (zgodnie z pismem Ministerstwa Finansów z 15 grudnia 1998 r. nr PP2-7406-1091/98/ASO). Miało to swoje uzasadnienie w unormowaniu art. 11 ust. 1 i 2 ustawy o podatku od towarów i usług, zgodnie z którym podatnicy są zobowiązani do obliczenia i wykazania w zgłoszeniu celnym kwoty podatku naliczonego, organ zaś jest zobowiązany do sprawdzenia kwoty podatku wykazanej w zgłoszeniu celnym. Jeżeli kwota podatku została wykazana nieprawidłowo, organ celny dokonuje jej weryfikacji. Dopiero zgłoszenie celne sprawdzone przez organ celny stanowi podstawę do odliczenia podatku naliczonego. Podstawą do odliczenia było więc sprawdzone zgłoszenie celne wraz z rejestrem towarów.