Zatrzymanie części wynagrodzenia na zabezpieczenie napraw gwarancyjnych

Jestem przedsiębiorcą w branży budowlanej. Na roboty budowlane udzielam gwarancji obejmującej określony okres (np. 2 lata). W czasie okresu gwarancji jestem obowiązany do dokonywania napraw na swój koszt. Aby zabezpieczyć wykonanie takich usług gwarancyjnych, zleceniodawca zatrzymuje część wynagrodzenia należnego za przeprowadzone roboty (np. 5 proc. należnego wynagrodzenia), z zastrzeżeniem, że kwota ta zostanie wykorzystana na pokrycie kosztów napraw i zostanie mi zwrócona po zakończeniu okresu gwarancji. W konsekwencji otrzymuję wynagrodzenie o 5 proc. niższe. Od jakiej kwoty powinienem odprowadzić VAT po wykonaniu usługi - czy od kwoty pomniejszonej o zatrzymaną przez zamawiającego część wynagrodzenia, czy od pełnej kwoty należnej za usługę?