Odliczanie podatku naliczonego od zapasów towarów

Kwestia, czy na pewno urząd skarbowy powinien wydać decyzję, której przedmiotem jest zgoda lub odmowa tej zgody na zmniejszenie podatku należnego o podatek naliczony wynikający z faktur dokumentujących zakupy podatnika przed dniem utraty zwolnienia od VAT lub rezygnacji z tego zwolnienia, jest kwestią sporną. Wyrażane są bowiem poglądy, iż decyzja taka nie rozstrzyga co do istoty żadnej sprawy podatkowej. Nie jest też decyzją kończącą postępowanie, ponieważ żadne postępowanie w sprawie zmniejszenia podatku należnego nie powinno się toczyć. Dlatego też niektórzy uważają, iż wyrażenie woli organu podatkowego będące ustosunkowaniem się tego organu do czynności podatnika, polegającej na przedłożeniu w urzędzie skarbowym spisu z natury, o którym mowa w art. 14 ust. 3 pkt 1 ustawy o VAT, powinno nastąpić w formie zwykłego pisma - informacji. Z tych powodów formułowane są poglądy co do braku podstaw formalnych do wydania decyzji.