Jak dokumentować koszty zwrócone przyjmującemu zamówienie

Podatnik założył działalność gospodarczą i będzie świadczył usługi na rzecz byłego pracodawcy (był zatrudniony na podstawie umowy o pracę). Na etacie podatnik zatrudniony był na stanowisku inżyniera budowy, a teraz będzie wykonywał usługi jako monter instalacji elektrycznych - PKD 43.21.Z, 42.22.Z, 27.12.Z, 95.22.Z. Podatnik wykonując pracę na terenie Polski będzie otrzymywał zwrot kosztów noclegu, podróży. Na jakiej podstawie te koszty mają być zwracane? Nota obciążeniowa w tej sytuacji? Czy kolejna pozycja na fv? Czy to będzie podlegało opodatkowaniu?